Запросите настройку EXPLAIN для подготовленного запроса
int sqlite3_stmt_isexplain(sqlite3_stmt *pStmt);
sqlite3_stmt_isexplain(S) вернет 1, если подготовленный запрос S это
запрос EXPLAIN, 2, если запрос S это EXPLAIN QUERY PLAN.
sqlite3_stmt_isexplain(S) вернет 0, если S обычный запрос или NULL.